Während die Bauern für die Bewässerung auf den Rio Grande angewiesen sind, stammt ein Großteil des Wassers, das die Bewohner von El Paso trinken, aus tief unter der Erde liegenden Grundwasserleitern. Auch diese kritischen Wasserquellen sind gefährdet.
1979 prognostizierte das Texas Water Development Board, dass El Paso bis 2031 das Grundwasser ausgehen würde. Zu dieser Zeit verbrauchte jeder Einwohner durchschnittlich über 200 Liter Wasser pro Tag. Der größte Teil dieses Wassers wurde aus den beiden Grundwasserleitern der Stadt gezogen – dem Hueco Bolson im Osten und dem Mesilla Bolson im Westen.
Für die nächsten zwei Jahrzehnte startete der Wasserversorger eine Kampagne, die die Bewohner dazu aufforderte, weniger Wasser zu verbrauchen, indem sie unter anderem ihre Rasenflächen durch einheimische Pflanzen ersetzten. Heute liegt der durchschnittliche Wasserverbrauch bei 134 Gallonen pro Person und Tag. Das ist immer noch höher als der nationale US-Durchschnitt von 82 Gallonen, aber niedriger als der Verbrauch an einigen anderen Orten des Landes mit ähnlich trockenem Klima, wie Arizona (145 Gallonen) und Utah (169 Gallonen).
Die Grundwasserleiter sind dadurch in einem besseren Zustand – etwas. „Der Wasserspiegel sinkt, aber nicht wie ein Fels“, sagt Scott Reinert, Ressourcenmanager von El Paso Water. Trotzdem kommt mehr Wasser aus dem Grundwasserleiter als wieder hinein.
El Paso Water pumpt jedes Jahr zwischen 40.000 und 50.000 Acre-Fuß Wasser aus dem Hueco Bolson und ersetzt jährlich etwa 5.000 Acre-Fuß. (Ein Acre-Fuß ist eine unhandliche Maßeinheit, die von Wasserversorgern verwendet wird – es ist genug Wasser, um einen Morgen Land oder etwas mehr als ein halbes Fußballfeld mit einem Fuß Wasser zu bedecken.) Es gibt auch eine gewisse natürliche Wiederauffüllung durch anderes Grundwasser und den Fluss, aber es ist wahrscheinlich nicht genug, um mit dem Pumpen Schritt zu halten.