Mit 22 Jahren gilt Nunez als einer der klügsten jungen Stürmer im Weltfußball. Er machte sich in La Liga 2 mit Almeria einen Namen und erzielte 16 Tore in 30 Spielen, bevor Benfica 2020 für ihn wechselte.
Nunez hatte eine relativ erfolgreiche Debütsaison im Estadio da Luz und stellte sein Talent als Spielmacher mit 11 Vorlagen in allen Wettbewerben unter Beweis. Aber er genoss in der vergangenen Saison einen Durchbruch vor dem Tor und erzielte in allen Wettbewerben 34 Tore.
In der Champions League erregte der Uruguayer die Aufmerksamkeit von Klubs in ganz Europa, als er beim 3:0-Sieg gegen Barcelona in der Gruppenphase zwei Tore erzielte. Er erzielte auch den Siegtreffer gegen Ajax im Achtelfinale, bevor er im Viertelfinale gegen Liverpool zweimal traf.