Janine besuchte die Syracuse University, bevor sie an das Russell Sage College in Troy, NY wechselte. Sie schloss ihr Studium 1964 ab. Vier Jahre später erwarb sie einen Master in Russischstudien an der New York University, wo ihr ein Professor vorschlug, sich bei der CIA zu bewerben
„Ich wusste, dass ich ein abenteuerliches Leben führen wollte“, sagte sie der Washington Post im Jahr 2004. „Und ich habe es bekommen.“
Sie trat 1968 in das Ausbildungsprogramm der Agentur ein, eine von sechs Frauen in einer Klasse von über 60. Obwohl ihre Ausbilder sie drängten, eine Stelle als Analytikerin anzunehmen, bestand sie darauf, Sachbearbeiterin zu werden, sagte sie in einem Interview mit The Post -Standard 1998. Im März 1969 wurde sie als alleinstehende Frau (sie hatte sich von ihrem ersten Ehemann Howard Brookner scheiden lassen) mit einem 6-jährigen Sohn im Schlepptau nach Manila geschickt.
„Die Leute denken, dass es wirklich schwer ist, ein Doppelleben zu führen, aber es wurde sehr natürlich“, sagte sie The Post-Standard. „Nachdem ich 25 Jahre Undercover gelebt hatte, fiel es mir sehr schwer, den Leuten zu sagen, was ich wirklich gemacht habe. Den Leuten zu erzählen, dass ich für die CIA gearbeitet habe, war traumatisch.“
Nachdem ihr Aufenthalt auf den Philippinen 1972 beendet war, wurde sie nach Thailand (wo sie Colin Thompson heiratete, ebenfalls einen CIA-Offizier), Venezuela, die Vereinten Nationen und Jamaika entsandt.
Während ihrer Zeit bei den Vereinten Nationen in den 1980er Jahren erzählte sie ihren Vorgesetzten, dass sie glaubte, ein anderer CIA-Offizier, Aldrich Ames, sei ein Sicherheitsrisiko, der während seines vorübergehenden Einsatzes rücksichtslos über geheime Operationen gesprochen und seine Freundin in ein CIA-Sicherheitshaus in Manhattan gebracht habe. Ihre Warnung wurde nicht beachtet, und Herr Ames, der 1985 mit der Spionage für die Sowjetunion begann, bekannte sich 1994 der Spionage und Steuerhinterziehung schuldig.
Frau Brookner schloss ihr Jurastudium 1998 ab und begann, von zu Hause aus zu arbeiten, wobei sie Fälle von Diskriminierung aufgrund des Geschlechts bei der CIA bearbeitete und Whistleblower verteidigte. Sie zog Kunden aus dem Außenministerium, dem Landwirtschaftsministerium und der Agentur für internationale Entwicklung an.
„Sie nannte es Arbeitsrecht – Leute mit Problemen in der Regierung“, sagte Herr Thompson, von dem sie geschieden war, mit dem sie aber befreundet blieb.